«Капітанша» — це продовження багатосерійного фільму, в якому головна героїня разом зі своїм чоловіком не тільки доводить, що жінка на кораблі — це не до біди, а й розплутує клубок інтриг.
Дії серіалу розгортаються через два роки після першого сезону. Олександра знайшла своє щастя разом із Леонідом Верховцевим, а тепер ще хоче стати і повноправною його помічницею, тому вступає вчитися в морехідне училище. Леонід же мріє отримати корабель у власне володіння. Поки закохані насолоджувалися одне одним і будували плани про спільне майбутнє і другу дитину, навколо них починав утворюватися клубок інтриг, який створюють їхні недруги.
Вороги Леоніда та Олександри починають їм мститися відкрито. Капітанші доведеться знову взяти в руки штурвал. Разом із чоловіком вони потраплять у справжній вихор подій і стануть пішаками в чужій грі. Саша і Леонід знову змушені розлучитися один з одним і це стане для пари справжнім випробуванням. Їм доведеться не тільки розмотати клубок інтриг, а й також розібратися з тими помилками, яких вони припустилися стосовно одне одного.
